Di Indonesia, pemanfaatan tanaman sebagai obat-obatan juga telah berlangsung ribuan tahun yang lalu.
[ Pada pertengahan [[abad ke XVII]] seorang ''botanikus'' bernama [[Jacobus Rontius (1592 – 1631)]] mengumumkan khasiat tumbuh-tumbuhan dalam bukunya ''De Indiae Untriusquere Naturali et Medica''.][ Meskipun hanya 60 jenis tumbuh-tumbuhan yang diteliti, tetapi buku ini merupakan dasar dari penelitian tumbuh-tumbuhan obat oleh [[N.A. van Rheede tot Draakestein (1637 – 1691)]] dalam bukunya ''Hortus Indicus Malabaricus''.][ Pada [[tahun 1888]] didirikan ''Chemis Pharmacologisch Laboratorium'' sebagai bagian dari [[Kebun Raya Bogor]] dengan tujuan menyelidiki bahan-bahan atau zat-zat yang terdapat dalam tumbuh-tumbuhan yang dapat digunakan untuk obat-obatan.][ Selanjutnya penelitian dan publikasi mengenai khasiat tanaman obat-obatan semakin berkembang.]
Pada bagian tanaman seperti yang tercantum di bawah ini dapat dimanfaatkan sebagai obat. Bagian tanaman terdiri dari bagian daun, kulit batang, buah, biji, bahkan pada bagian akarnya.
